Музей истории Ярославля открылся в 1985 году как филиал Ярославского музея-заповедника, самостоятельный - с 1998 года. Располагается в двухэтажном здании бывшей усадьбы В.Я.Кузнецова на Волжской набережной.
Залы первого этажа рассказывают о городе с 11 до середины 20 века, на втором - с 1960х годов, там же находятся выставочные залы.
На территории музея также находится Мемориал Жертв войн и репрессий XX столетия.